Konfigurace CVS je uložena v cvs repository jako jeden s projektů s názvem CVSROOT. Administrace tedy probíhá tak že si „vytáhneme“ tento projekt k sobě do pracovní oblasti, provedemé úpravy a posléze příkazem commit tuto novou konfiguraci zapíšeme.

$ cd ~/src
$ export CVSROOT=cvs.firma.cz:/var/lib/cvs
$ export CVS_RSH=ssh
$ cvs checkout CVSROOT